Этимъ комиссія заключила свою дѣятельность.
23-го сентября 1906 года послѣдовало, по всеподданнѣйшему докладу военнаго министра, Высочайшее соизволеніе на закрытіе комиссіи; при этомъ Его Величество соизволилъ повелѣть военному министру, въ письмѣ на имя предсѣдателя, передать ему и членамъ комиссіи благодарность Его Величества за тщательное и добросовѣстное исполненіе возложеннаго на нихъ труда.
Подводя итоги дѣятельности слѣдственной комиссіи, надлежитъ сказать, что они выразились въ 10 постановленіяхъ и 81 протоколѣ допроса 44 свидѣтелей и ознакомленіи съ дѣлами и документами, охватывавшими весь періодъ владѣнія нами Квантунскимъ полуостровомъ и Портъ-Артуромъ, составившими вмѣстѣ 6 томовъ съ 2104 листами.
Комиссіи не удалось допросить 7 намѣченныхъ было ею къ допросу свидѣтелей (ген.-м. Бѣлаго, полк. Петруша, кап. Сычева, шт.-кап. Адо, капит. 2 ранга Циммермана, д-ра Ястребова и г. Тауца).
Изъ состава комиссіи за 1 1/2 года ея дѣятельности выбыли три члена: адмиралы Бирилевъ -- въ виду назначенія его морскимъ министромъ, и Дубасовъ -- въ виду назначенія его Московскимъ генералъ-губернаторомъ -- и генералъ-лейт. Платоновъ -- за назначеніемъ его къ присутствованію въ Сенатѣ.
Дѣятельность исп. обяз. военнаго слѣдователя д., т. с. Быкова.
15-го августа 1906 года д. т. с. Быковъ составилъ постановленіе (No 1) о принятіи имъ дѣла къ своему производству.
Теперь слѣдствіе должно было вестись уже не о происшествіи -- сдачѣ кр. Портъ-Артуръ японскимъ войскамъ, а о виновности въ этомъ происшествіи опредѣленныхъ лицъ. Поэтому одновременно съ принятіемъ дѣла новымъ слѣдователемъ принята была въ отношеніи обвиняемыхъ мѣра пресѣченія имъ способовъ уклоняться отъ слѣдствія и суда. таковою, на основаніи 470, 473 и 474 ст. ст. воен.-судеб. устава, "въ виду высокаго ихъ служебнаго положенія", избранъ былъ ближайшій надзоръ начальства.
Затѣмъ послѣдовали допросы, теперь уже не въ качествѣ свидѣтелей, а какъ обвиняемыхъ, генер.-лейт. Смирнова -- 9-го сентября (протоколъ No 1), ген.-м. Рейса -- 12-го сентября (протоколъ No 2), ген.-лейт. Фока -- 16-го и 17-го сентября (протоколы NoNo 3 и 4).
Для разъясненія обстоятельствъ Цзиньчжоускаго боя и дѣятельности во время его генераловъ Стесселя и Фока, а также для разъясненія обстоятельствъ сдѣланной было ген.-адъют. Куропаткинымъ попытки отозвать Стесселя изъ Портъ-Артура допрошенъ былъ 18-го сентября ген. шт. кап. Одинцовъ, состоявшій въ день боя у Цзиньчжоу при ген. Фокѣ офицеромъ для связи, а послѣ этого боя пробравшійся изъ Портъ-Артура на миноносцѣ въ Манчжурскую армію для доклада о состояніи крѣпости и, по порученію ген. Смирнова, о непригодности къ управленію ея обороной ген. Стесселя (прот. No 5).