Все слѣдственное дѣло состояло теперь изъ 7 томовъ на 2,456 листахъ, 31-го NoNo приложеній и 12-ти NoNo вещественныхъ доказательствъ (плановъ, дѣлъ, отдѣльныхъ документовъ, полевыхъ книжекъ, телефонограммъ, приказовъ, журналовъ военныхъ дѣйствій, совѣта обороны и т. н.).
Уже по заключеніи предварительнаго слѣдствія, 11-го ноября 1906 года, д. т. с. Быковъ получилъ изъ военнопоходной канцеляріи Е. И. В. увѣдомленіе, что по всеподданнѣйшему докладу временно командующимъ Императорскою Главною Квартирою просьбы отставного генералъ-лейтенанта Стесселя Государь Императоръ Высочайше соизволилъ разрѣшить д. т. с. Быкову извлечь нужныя для дѣла свѣдѣнія изъ хранящагося въ канцеляріи "чернового журнала сухопутной обороны крѣпости Портъ-Артура", который
18-го марта 1905 года былъ представленъ Его Величеству бывшимъ личнымъ адъютантомъ генерала Кондратенко, поручикомъ Гриневичемъ.
Во исполненіе Высочайшей воли, д. т. с. Быковъ 15-го, 17-го и 18-го ноября 1906 г. ознакомился съ содержаніемъ указаннаго выше документа. Оказалось, что журналъ этотъ помѣщенъ въ 14 писанныхъ чернилами тетрадяхъ, не пронумерованныхъ, не скрѣпленныхъ, и неизвѣстно гдѣ и кѣмъ веденныхъ. Содержаніе ихъ составляютъ краткія свѣдѣнія какъ о тѣхъ приспособленіяхъ, которыя дѣлались для обороны крѣпости, такъ и о самой оборонѣ крѣпости, начиная съ 27-го января 1904 г. по G-е декабря того я-te года, при чемъ пропущены числа съ 21-го по 26-е февраля включительно и весь августъ мѣсяцъ, за исключеніемъ 20-го числа, которое помѣщено на отдѣльныхъ листахъ. Кромѣ того, въ отдѣльной тетради, записаны числа и мѣсяцы боевъ подъ Портъ-Артуромъ, начиная съ боя у Зеленыхъ горъ 18-го іюня 1904 г., и кончая оставленіемъ форта No II въ ночь на 6-е августа. Все занесенное въ этотъ журналъ оказалось не имѣющимъ ни прямого, ни косвеннаго отношенія къ возникшимъ на генерала Стесселя обвиненіямъ; въ немъ нѣтъ свѣдѣній ни о числѣ защитниковъ на позиціяхъ, ни о числѣ орудій, ни о числѣ снарядовъ къ нимъ.
Независимо отъ "чернового журнала сухопутной обороны крѣпости Портъ-Артуръ" поручикомъ Гриневичемъ были представлены Его Величеству еще 14 отдѣльныхъ приложеній: 1) черновикъ донесенія ген. Стесселя Намѣстнику и командующему арміею отъ 7 часовъ утра 13-го августа 1904 г., слѣдующаго содержанія:
"Начиная съ 5-го по 13-е августа, всѣ ежедневные штурмы японцевъ отбиты съ громаднымъ урономъ для нихъ, но и мы потеряли ранеными съ 5-го по 11-е число включительно 69 офицеровъ и 3,466 нижнихъ чиновъ, убитыхъ тоже много, но число ихъ еще не приведено въ извѣстность. Въ госпиталяхъ состоитъ 132 офицера и 5,661 нижній чинъ. Снарядовъ полевой артиллеріи по 150 на орудіе. Орудія крѣпостныя въ большомъ числѣ подбиты. Подъ ружьемъ въ 4-й дивизіи 9,419, въ 7-й дивизіи 11,169 нижн. чиновъ, офицеровъ въ 4-й дивизіи 145, въ 7-й дивизіи 150. За 12-е число потери также значительны. Необходимо выслать подкрѣпленіе, хотя два полка съ большимъ числомъ офицеровъ, можно съ особою осторожностью на иностранныхъ пароходахъ; также необходимо выслать и снаряды.Редуты 1 и 2 никто не занимаетъ, они представляютъ развалины. Духъ защитниковъ геройскій. Начиная съ 25-го іюня идетъ бомбардировка и города; масса домовъ разрушено.
2) приказъ ген. Стесселя по войскамъ Квантунскаго укрѣпленнаго раіона отъ 20-го декабря 1904 г., No 984, о сдачѣ крѣпости Портъ-Артуръ на капитуляцію, съ изложеніемъ основаній къ сдачѣ; 3) приказъ ген. Стесселя отъ того же числа, No 985, заключающій въ себѣ распоряженія, относящіяся до передачи фортовъ японцамъ; 4) распоряженія ген. Горбатовскаго, отъ 21-го декабря, относительно сдачи японцамъ оружія, патроновъ, патронныхъ сумокъ, патронташей, поясныхъ ремней съ бляхами и шанцеваго инструмента; 5) приказъ ген. Стесселя, отъ 22-го декабря, No 994, о разрѣшеніи Государя Императора офицерамъ портъ-артурскаго гарнизона или возвратиться въ Россію подъ обязательствомъ не принимать участія въ войнѣ, или раздѣлить участь нижнихъ чиновъ; 6) письмо ген. Кондратенко къ ген. Флугу отъ 28-го января 1904 г. No 27 съ просьбою не выводить изъ Портъ-Артура 10-го полка; 7) диспозиція крѣпости Портъ-Артуръ 17-го іюля 1904 г.; 8) черновикъ доклада ген. Стесселя къ командующему войсками Манчжурской арміи (безъ числа и мѣсяца), о томъ, что
"японцы могутъ произвести высадку, подобно 1895 г., на восточномъ побережьѣ Ляодунскаго полуострова, примѣрно на линіи Бидзево -- Дагушанъ, и что весь плацдармъ Ляодуна безъ войскъ, а флотъ мало поможетъ затрудненію высадки по мелководью. Между тѣмъ, на Ялу стоятъ наши войска. Зачѣмъ японцы пойдутъ чрезъ Ялу бить на трудныя позиціи. Хорошо бы сосредоточить войска у Гайджоу, это дастъ намъ ту выгоду, что будетъ неожиданностью для японцевъ. Въ настоящее время захватъ Артура равносиленъ потери флота, хотя я увѣренъ, что Артуръ не возьмутъ открытою силою, но вводить это предположеніе все-таки не невозможно".
Къ этому ген. Стессель добавлялъ, что докладъ составленъ имъ по его личнымъ и ген. Кондратенко соображеніямъ; 9) перечень необходимыхъ построекъ для усиленія Цзиньчжоуской позиціи на сумму 60,550 руб., подписанный ген. Кондратенко, командиромъ 5-го Восточно-Сибирскаго стрѣлковаго полка полковн. Третьяковымъ и военнымъ инженеръ-капитаномъ фонъ-Шварцемъ; 10) докладъ къ указанному выше перечню, подписанный тѣми же лицами; 11) записка ген. Кондратенко, отъ 21-го февраля 1904 г., No 58, адресованная, вѣроятно, ген. Стесселю, о необходимости предоставить ген. Фоку полную свободу въ принятіи мѣръ къ оборонѣ какъ Цзиньчжоуской позиціи, такъ и всего сѣвернаго участка Портъ-Артурскаго укрѣпленнаго раіона; 12) записка ген. Кондратенко ген. Флугу о томъ, что сдѣлано по артиллерійской и инженернымъ частямъ въ крѣпости Портъ-Артуръ съ 27-го января по 8-е февраля 1904 г., а также о сформированіи дружины въ 130 человѣкъ, запаснаго баталіона 3-й бригады и о формированіи 7-й бригады; 13) докладъ ген. Кондратенко отъ 15-го февраля коменданту крѣпости о необходимости привести въ негодность 100 большихъ шаландъ, раскиданныхъ по берегу бухты Луизы, и 14) схема обороны Ляотешанскихъ высотъ, составленная начальникомъ Ляотешанской обороны подполковникомъ Надхинымъ.
Протоколъ осмотра всѣхъ этихъ документовъ, препровожденный д. т. с. Быковымъ главному военному прокурору