По окончании университета в 1899 г. Бачинский был оставлен при кафедре физики и в 1900 г. опубликовал первые работы. В 1901 г. был командирован в Геттинген. В 1907 г. был утвержден приват-доцентом Московского университета. В 1900-х -- 1910-х гг. также преподавал в гимназиях, писал статьи для энциклопедического словаря "Гранат".
В 1900-х гг. Бачинский сблизился с кружком московских символистов, группировавшихся вокруг издательства "Гриф", и Г. Г. Шпетом. В 1905 г. выпустил поэму в прозе "Облака"; критики отмечали ее сходство с "симфониями" А. Белого ("физик Бачинский вдруг выпустил книжечку "Облака", подражающую симфонии Белого: под псевдонимом "Жагадис"" -- отмечал в "Воспоминаниях о Блоке" сам Белый).
С 1906 г. выступал со стихами, литературно-публицистическими статьями и рецензиями в журналах "Золотое руно" и "Перевал", газ.; позднее публиковался также в "Русской мысли" (научно-популярные статьи) и других периодических изданиях.
С 1918 г. Бачинский состоял профессором физики МГУ, опубликовал в общей сложности более 60 научных трудов, основные из которых посвящены вопросам молекулярной физики и термодинамики, в частности изучению поверхностного натяжения и вязкости жидкостей; еще в 1912 г. он вывел закон вязкости жидкости ("закон Бачинского").
С 1920-х гг. много занимался вопросами преподавания физики, составил ряд задачников, учебников и учебных пособий для средней школы. В 1926-1931 гг. состоял научным редактором "Рабочей школьной библиотеки", включавшей книги по физике и технике.
В 1930 г. в результате тяжелой болезни Бачинский потерял зрение, однако с помощью дочери продолжал научную работу и составление учебников вплоть до своей кончины в 1944 г.
Поэма "Облака" публикуется по первоизданию (М.: "Скорпион", 1905) с исправлением ряда устаревших особенностей орфографии и пунктуации. В оформлении обложки использована обложка оригинального издания работы Н. Феофилактова.