17 сентября. Бреве Александра VI, отменяющее все буллы о привилегиях, дарованных до сих пор об изъятии от судопроизводства инквизиторов. 17 сентября. Бреве Александра VI, который дарует главному инквизитору право реабилитировать осужденных.
1 декабря. Бреве Александра VI, который назначает епископа дома Диего Десу, доминиканца, только инквизитором Кастилии. Деса отказывается до тех пор, пока папа распространит его юрисдикцию на Арагон.
1498 Указ инквизиции, разрешающий взимать денежные штрафы с примиренных для поддержки казны.
1499 1 сентября. Бреве Александра VI, который распространяет на королевство Арагон юрисдикцию Десы. Тот принимает.
5 сентября. Указ Фердинанда V, распространяющий на евреев, недавно прибывших в Испанию, меру изгнания, уже принятую против других евреев. 31 октября. Указ Фердинанда V, возвращающий свободу рабам-маврам, которые примут крещение. Конфликт юрисдикции между инквизицией и муниципалитетом Валенсии.
Аутодафе Хуана Вивеса, иудействующего, в Валенсии. Его дом снесен.
1500 17 июня. Новый устав Десы для трибунала инквизиции.
27 июля. Указ Фердинанда V об учреждении инквизиции в Сицилии. Жители противятся ей. Конфликт юрисдикции между инквизицией и судьями Кордовы.
Граф де Беналькасар отлучен инквизиторами Эстремадуры за защиту прав светской власти от посягательств святого трибунала.
1501 23 мая. Указ Фердинанда V, приказывающий устроить городскую площадь на месте дома Хуана Вивеса. Там выстроена часовня.