В 1618 г. протестанты съехались в Прагу с намерением подать жалобу императору, но ответ последнего не удовлетворил их.
Общее возбуждение, охватившее Прагу, переросло в восстание. Протестанты решили расправиться с своими главными противниками. Во время переговоров в Пражском кремле с королевскими советниками они выбросили из окна трёх из них (они остались живыми и бежали из Праги). Протестанты образовали своё правительство в составе 30 директоров из всех сословий, ввели налоги и приступили к организации войска.
Из страны были изгнаны иезуиты и высшее духовенство, бывшие проводниками влияния и опорой Габсбургов. Генеральный сейм чешской короны провозгласил себя законодательным органом и избрал королём после смерти Матвея главу южно-немецких протестантов курфюрста Фридриха Пфальцского (1619–1620).
Во главе восстания стояли чешские дворяне, но они не были поддержаны широкими народными массами. Военные силы восставших были незначительными. Фридрих Пфальцский не получил помощи от предполагаемых союзников, тогда как его противник, Фердинанд Габсбург, был поддержан Сигизмундом III — польским королём и седмиградским князем Габором, которому Фердинанд обещал Словакию. 8 ноября 1620 г. противники сразились в битве у Белой Горы около Праги, в которой немногочисленное чешское войско было разбито. Вожди восстания были арестованы и подверглись заточению. Имущество арестованных панов, рыцарей, мещан стоимостью в 500 млн. гульденов было конфисковано. 21 июня 1621 г. перед ратушей Старого города была совершена публичная казнь двадцати семи руководителей восстания, среди которых было трое мещан. Конфискованное имущество — имения и дома в городах — было роздано иностранцам, наводнившим страну.
§ 2. Экономический и культурно-политический упадок Чехии
После окончания гуситских войн в руках землевладельцев было сосредоточено огромное количество земель, как пустующих, так и населённых. Землевладельцы для восстановления своего хозяйства нуждались не в земле, а в рабочих руках. Поэтому земельные участки крестьян, которые считались наследственными, оставались пока в их владении. Крестьянство составляло основную силу, которая спасла Чехию от крестоносцев. В нём были живы гуситские традиции. Оно продолжало хранить их, несмотря на преследования первых Габсбургов.
Первые Габсбурги не посягали на чешскую культуру. Чешский язык оставался господствующим в суде, администрации, школе, в литературе, в церкви. В тот период появилось много оригинальных чешских произведений.
Переводились на чешский язык книги греческих и римских классиков.
После Белогорской битвы политическое, экономическое и культурное положение Чехии резко изменилось. Опираясь на панов-католиков и иностранцев, Габсбурги настойчиво проводили политику уничтожения всех следов гуситского движения. Монастыри всех орденов, основанные в Чехии, развернули активную деятельность. Руководители протестантских общин были изгнаны. Крестьян насильственно заставляли принимать католическую веру. В 1626 г. было предписано, чтобы все не-католики в течение двух месяцев присоединились к католической церкви под страхом изгнания из отечества. В ответ на это началась массовая эмиграция чешских средних и мелких землевладельцев. Среди эмигрантов был основатель современной педагогики Ян Амос Коменский и другие виднейшие чешские учёные.
Одновременно Габсбурги стремятся объединить Чехию с Австрией в административном и финансовом отношении. В 1627 г. Фердинанд II (1619–1637) опубликовал земский статут. Согласно ему сохранились чешское государство и связь земель чешской короны Чехии, Моравии и Силезии, но власть государя была очень расширена, а права сейма ограничены. Все высшие и некоторые низшие должностные лица отныне назначались королём и были больше королевскими, чем земскими чиновниками. Первым сословием в сейме стало духовенство, которое во время гуситских войн совсем не было в нём представлено. Немецкий язык стал государственным языком. Такими мероприятиями Габсбурги старались превратить Чехию в австрийскую провинцию и уничтожить всякое воспоминание об её национально-культурной самостоятельности.