В 1864 году 1 июля Оренбург пострадал от большого пожара, уничтожившего в старой слободке 600 домов. Имущественные убытки этого пожара выразились в сумме 692.894 руб. 85 коп. Погорельцам выдавалось пособие из государственного казначейства, городских сумм и из частных пожертвований на сумму 28.328 руб.; кроме денежных пособий, пострадавшим от пожара выдавался строевой лес.
В том же 1864 году 17 июня в Оренбурге учрежден городской общественный банк и возникло физико-медицинское общество.
В том же году Оренбургскому и Самарскому генерал-губернатору подчинено управление киргизами Сыр-Дарьинской линии, затем линия эта вошла в состав Туркестанской области с подчинением тому же генерал-губернатору (указ 12 февраля 1865 года).
В декабре того же 1864 года вместо Безака на должность Оренбургского генерал-губернатора назначен Н. А. Крыжановский, причем титул «и Самарского» был уничтожен, так как Самарская губерния была изъята из ведения начальника Оренбургского края (указ 2 февраля 1865 года).
Н. А. Крыжановский.
В 1865 году 5 мая Оренбургский край разделился еще на две губернии: Уфимскую и Оренбургскую. По приезде Крыжановского в Оренбурге открыты губернские учреждения: губернское правление, казенная и судебная палаты. Первым Оренбургским гражданским губернатором назначен Боборыкин.
В том же 1865 году открыт Оренбургский военный округ, и Крыжановский назначен командующим войсками того округа.
В том же году открыта Оренбургская губернская типография, а на Форштадтской площади произведена постройка двух обширных казарм и тем самым навсегда прекращена надобность отводить солдатам квартиры в частных домах; в том же году заложен архиерейский дом, оконченный постройкой в 1868 году.
В 1866 году в Оренбурге открыт губернский статистический комитет и стали издаваться «Оренбургские губернские ведомости»[32], тогда же 15 ноября последовало открытие Оренбургского государственного банка.