Монастырь в общем признается благоустроенным. Он имеет несколько участков собственной земли (свыше 1000 десятин), свой восковой свечной завод и мастерские: иконописную и золотошвейную; сверх того, сестры занимаются приготовлением просфор для городских церквей, чтением псалтыри по умершим, фабрикацией искусственных цветов и другими женскими рукоделиями, а на монастырском хуторе ― сельским хозяйством.
Стройное церковное пение, чистота и образцовый во всем порядок привлекают в монастырь много богомольцев.
В расстоянии около трех верст от города на Маяке (гора) находится заштатный Богодуховский мужской монастырь. Основание его относится к 7 января 1867 года. До 1900 года монастырь состоял в числе штатных второклассных монастырей Российской Империи и содержался на казенные средства, в названном же году по ходатайству бывшего Оренбургского епископа Владимира обращен в заштатный и приписан к архиерейскому дому.
Богодуховский монастырь расположен в живописной местности на возвышенном берегу реки Сакмары, откуда в летнее время открывается чудный вид на лесистые берега названной реки с зелеными ее лугами и на ближайшее селение Подгородную Покровку.
Один из сотрудников местных газет в таких красках изображает Богодуховский монастырь: «Монастырь окружен каменной стеной. Между другими монастырскими постройками главная монастырская церковь Иоанна-Предтеченская отличается изяществом в мавританском стиле. Большой купол, красивая колоколенка, крылечки, веранды, терраски и другие украшения производят на посетителя весьма приятное впечатление. В былое время на монастырском дворе летнею порою разбивались роскошные цветники. Со вкусом расположенные клумбы цветов, прекрасное сочетание красок, тень от деревьев, воздух, наполненный ароматами цветов и степных растений, тишина, нарушаемая лишь меланхолическим шепотом древесных листьев, ― все это заставляло посетителя хотя и на время забывать о городской пыли и чувствовать себя на лоне природы».
Ежегодно на второй день праздника Св. Троицы (Духов день) и 24 июня, в день храмового праздника, в монастырь стекается из города много богомольцев.
В 1901 году при Богодуховском монастыре открыт миссионерский противомусульманский стан со школой и интернатом для крещеных инородцев.
Близ монастыря по берегу реки Сакмары и старого ее русла расположены городские дачи, признаваемые лучшими в гигиеническом отношении.
Во время управления Оренбургской епархией епископа Макария, в 1895 году возник Успенско-Макарьевский мужской монастырь. Он находится в расстоянии 14 верст от города по тракту в Чернореченский казачий поселок и расположен в степной местности на берегу небольшой речки Каргалки. Средства на устройство и первоначальное образование монастыря, около 300 тыс. рублей, даны Оренбургским купцом А. Г. Мещеряковым, почему и самый монастырь на обыденном разговорном языке носит название «Мещеряковского».
За упразднением Богодуховского монастыря Успенско-Макарьевский обращен в штатный и содержится на казенный счет.