До последнего времени в состав Ц. У. С. входило Главное Военно-Санитарное Управление.
Постановлением Совнаркома от 30 августа 1918 года, названное Управление слилось с Народным Комиссариатом Здравоохранения на следующих основаниях:
1) Главное Военно-Санитарное Управление, подчиняясь Народному Комиссариату Здравоохранения, руководствуется в своей деятельности военными законами, а также приказами и постановлениями, изданными до сих пор и имеющими быть изданными Народным Комиссариатом Здравоохранения по соглашению с Народным Комиссариатом по военным делам. Служащие в Главном Военно-Санитарном Управлении и подведомственных ему учреждениях и заведениях пользуются правами и несут обязанности военнослужащих, согласно действующим по этому предмету для Комиссариата по военным делам законам и правилам.
2) Народный Комиссариат Здравоохранения и его заместитель пользуются по отношению к Военно-Санитарным учреждениям и заведениям, а равно по отношению к медико-санитарному делу воинских частей всеми правами Народного Комиссариата по военным делам. Должностные лица, уполномоченные народным комиссаром Здравоохранения, имеют право медико-санитарного контроля во всех военно-санитарных учреждениях, заведениях и войсковых частях.
Примечание. На театре военных действий контроль производится по соглашению с командующим фронтом или армией.
3) Все назначения, перемещения и увольнения по военно-санитарному ведомству производятся приказами по этому ведомству, причем назначения на высшие ответственные должности врачей утверждаются Народным Комиссаром Здравоохранения.
4) Все виды довольствия и снабжения Военно-Санитарное Управление с подведомственными ему учреждениями и заведениями получает из соответствующих довольствующих органов Народного Комиссариата по военным делам и Здравоохранения по принадлежности.
5) На военно-санитарные учреждения и заведения, если это не нарушает их прямого назначения, может возлагаться комиссарами здравоохранения обязанность обслуживать гражданское население, а на гражданские учреждения и заведения — обслуживать армию.
6) Окружные военно-санитарные управления подчиняются непосредственно главному военно-санитарному управлению Народного Комиссариата Здравоохранения.
7) В качестве органов, ведающих военно-санитарное дело, в губерниях учреждены военно-санитарные подотделы медико-санитарных отделов при губсовдепах, согласно особому положении).