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—— Monograph of the British Umbilicariae. Ann. Mag. Nat. Hist., Ser. 2, XVIII. pp. 273-297 (1 pl.), 1856.
—— Notes on Lichens collected by Sir John Richardson in Arctic America. Journ. Linn. Soc. Bot. IX. pp. 184-200 (1 pl.), 1867.
—— Notulae Lichenologicae, No. XXX. Further Notes on the Lichens of Cader Idris, North Wales. Ann. and Mag. Nat. Hist., Ser. 4, IV. pp. 198-202, 1869.
—— The Lichens of Ceylon collected by G. H. K. Thwaites. Trans. Linn. Soc. XXVII. pp. 161-185 (2 pls.), 1869.
—— The Lichen Flora of Great Britain, Ireland and the Channel Islands. Shrewsbury, 1871; ed. 3, 1879.
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—— Écologie d’une petite panne dans les dunes des environs de Dunkerque. Bull. Soc. Bot. France, Sér. 4, XII. pp. 177-184, 207-284, 1912.