1567–1699: Cartas y expedientes del Gobr. de Filipinas vistos en el Consejo. 67–6–6 to 17. 12 legajos.
1583–1699: Cartas y expedientes del presidente y oidores de esta audiencia vistos en el Consejo. 67–6–18 to 26. 7 legajos.
1564–1699: Cartas y expedientes de los oficiales reales de Filipinas vistos en el Consejo. 67–6–29 to 33. 5 legajos.
1565–1650: Cartas y expedientes de personas seculares de dicha audiencia. 67–6–34 to 42. 9 legajos.
1629–1791: Reales cédulas, mercedes y informes sobre encomiendas. 105–2–24.
1651–1699: Cartas y expedientes de personas seculares de esta audiencia. 68–1–1 to 2. 2 legajos.
1616–1700: Confirmaciones de encomiendas de Indios. 68–1–5 to 16. 12 legajos.
1572–1691: Autos y otros papeles del Gobernador de Filipinas Don Juan de Silva contra los oficiales reales sobre uso excesivo de sus oficios. 68–1–21.
1670: Expediente formado de los procedimientos de Don Francisco Samaniego Tuesta, Oidor de la Audiencia de Manila. 68–1–23.
1615–1837: Materias gubernativas. 105–3–12.