Ao fundo da Igreja, e aos lados da grade do côro, estão dois túmulos de pedra artisticamente ornados, tendo nos tampos figuras de mulheres jacentes. O do lado do Evangelho encerra os ossos da Infanta D. Isabel, filha de D. Afonso IV, falecida com pouco mais de 2{28} anos e o do lado da Epistola supõe-se conter os restos de D. Maria, filha de D. Pedro I e de D. Constança.
Estes dois túmulos vieram tambem do velho convento de Santa Clara logo após a mudança da comunidade.
Dentro do côro da Igreja, em lugar menos proprio por falta de luz, conserva-se ainda hoje o tumulo de pedra onde primitivamente esteve depositado o corpa da Rainha Santa, túmulo este que, segundo as melhores opiniões, ela mandara fabricar em vida. As suas faces laterais são guarnecidas de várias imagens e de onze estatuetas de freiras metidas em nichos de gracioso desenho.
Sobre este túmulo vê-se estendida a figura da Rainha Santa envolta no hábito de freira clarista, sobraçando o bordão de peregrina, uma bolsa e um livro de orações.
A cabeça da imagem, primorosamente esculturada, repousa num largo almofadão a coberto dum elegante baldaquino, sendo este ladeado por dois anjos em atitude de turificarem a Rainha Santa.
Tanto este côro como o que lhe fica superior, eram adornados com riquíssimos altares de boa talha, muitos quadros de subido valor e bastantes imagens por quem as religiosas nutriam a mais piedosa devoção.
Muitos destes preciosos objectos estão depositados no Museu Machado Castro, de Coimbra.
Voltando á Igreja, onde se admira a preciosa estatua da Rainha Santa, essa delicada jóia que Teixeira Lopes delineou em momentos de feliz inspiração e perante a qual instintivamente se teem curvado tantos milhares de pessoas de todas as classes sociais, chamamos a atenção do leitor para os quadros que adornam a Capela-mór da Igreja, quasi todos referentes à vida da Rainha Santa, e recomendamos-lhe especialmente a sua{29} visita ao Museu de alfaias religiosas que a Confraria instituiu junto da Igreja e aonde se encontram algumas preciosidades de raro valor artístico. Êsse museu, que fica situado ao lado direito da Capela-mór, é precedido dum espaçoso corredor que serve de Galeria dos Irmãos Benemeritos. Ao fundo, noutra sala mais espaçosa, estão guardados os objectos de maior valor pertencentes á Confraria, figurando entre êles alguns que eram do uso da Rainha Santa. Neste precioso museu está exposto um colar de pedras preciosas com que a Rainha Santa costumava adornar as donzelas pobres no dia do seu casamento, guardando-se tambem ali algumas peças do seu vestuario e a roupa com que foi amortalhada. Todos estes objectos devem merecer uma particular atenção ao visitante de Santa Clara.
A respectiva Confraria é digna dos maiores louvores pela dedicação e zelo que tem mostrado na conservação deste Museu, procurando enriquecê-lo cada vez mais com a adquisição dos objectos que digam respeito á Rainha Santa. Ultimamente foi ali exposto o Breve Original, obtido por El-rei D. João III da Curia romana, e pelo qual é extensivo a toda a nação o culto de Santa Isabel. Este documento, muito bem conservado ainda, é digno de particular atenção pelo fino desenho dos seus ornatos e caracteres.
O claustro de Santa Clara, situado ao lado esquerdo da Igreja, é tambem digno de ser visitado. As suas magestosas proporções, as arcadas, e as graciosas varandas que o circundam, formam um conjunto agradavel ao nosso sentimento, transportando-nos á vida dum mundo superior, em tudo mais perfeito e harmonioso.