Первые годы пребыванія въ Ялуторовскѣ Иванъ Ивановичъ жилъ вмѣстѣ съ Е. П. Оболенскимъ, занимая просторный домъ купца Бронникова, но когда Евгеній Петровичъ женился, то Иванъ Ивановичъ поселился одинъ на квартирѣ. Климатическія условія Сибири вредно дѣйствовали на его здоровье", почему онъ ходатайствовалъ о переводѣ его изъ Туринска въ Ялуторовскъ, въ городъ съ лучшими климатическими условіями, что и было ему разрѣшено. "Во время шестнадцатилѣтлѣтняго пребыванія въ Сибири, -- продолжаетъ Дмитріевъ-Мамоновъ, -- Иванъ Ивановичъ аттестовался, какъ полиціею, такъ и тобольскими губернаторами, лицомъ, отличающимся "хорошимъ поведеніемъ". По воспослѣдованіи всемилостивѣйшаго манифеста 26 августа 1856 года Иванъ Пущинъ выбылъ изъ Сибири въ Россію".
Жизнь въ Россіи ознаменовалась для Пущина, между прочимъ, его женитьбой на вдовѣ его умершаго товарища и соузника Фонъ-Визина Н. Д. Фонъ-Визиной. По свидѣтельству кн. М. Н. Волконской, Фонъ-Внянна вышла замужъ за Пущина, когда ей было уже 53 года отъ роду.
Находясь въ Россіи, по просьбѣ одного изъ своихъ друзей, Пущинъ написалъ "Записки", касающіяся его отношеній къ Пушкину. Эти записки были напечатаны въ мартъ-апрѣльской книжкѣ журнала "Атеней" за 1859 годъ. ("Журналъ критики, современной исторіи и литературы, подъ редакціею Е. Корша"), но, по обыкновенію, съ цензурными купюрами, возстановленными только заграницею въ герценовской "Полярной Звѣздѣ" за 1862 годъ. Такъ обстояло дѣло до 1899 года, когда Л. Н. Майковъ издалъ свою извѣстную книгу "Пушкинъ -- біографическіе матеріалы и историко-литературные очерки". Въ книгу эту вошли полностью и Записки И. И. Пущина.
Кромѣ этихъ записокъ Пущинъ написалъ также, по нѣкоторымъ даннымъ, совмѣстно съ Е. И. Оболенскимъ, очеркъ подъ заглавіемъ "14 декабря". Очеркъ этотъ былъ напечатанъ въ изданномъ Герценомъ сборникѣ "Тайное общество и 14 декабря".
Наконецъ, въ кн. III "Русскаго Архива" за 1879 г. было напечатано письмо Пущина къ директору Царскосельскаго лицея Е. А. Энгельгарду (отъ 1845 г.). Въ письмѣ этомъ Пущинъ живо и ярко рисуетъ свое подневольное существованіе въ Ялуторовскѣ.
И. И. Пущинъ скончался 3 апрѣля 1859 года въ сельцѣ Марьино близъ Бронницѣ Московской губерніи и похороненъ въ Бронницахъ около стараго собора.
Таковъ краткій очеркъ жизни и дѣятельности одного изъ замѣчательнѣйшихъ русскихъ людей, дѣйствовавшихъ на аренѣ общественной жизни второго и третьяго десятилѣтія XIX в., друга поэта, такъ страстно желавшаго видѣть "народъ неугнетеннымъ" и "отечество свободой просвѣщеннымъ", борца и мученика за Россію, за благо и счастье родного народа.
Тяжкія испытанія не сломили его благородную натуру.