В «Наказе» Комитету Александр I повелел «принять к извлечению флота из настоящего мнимого его существования, и к приведению оного в подлинное бытие».
В чём заключалось это «подлинное бытие» флота, видно из доклада Воронцова императору:
«По многим причинам... России быть нельзя в числе первенствующих морских держав, да в том ни надобности, ни пользы не предвидится. Прямое могущество и сила наша должна быть в сухопутных войсках...
Посылка наших эскадр в Средиземное море и другие дальние экспедиции стоили государству много, делали несколько блеску и пользы никакой»[390].
Оспаривать такие неправильные и совершенно бессмысленные утверждения относительно героической истории русского флота Ушаков не мог потому, что не имел доступа ко двору и не был членом Комитета. Писать же императору, как он это делал раньше, также было бесполезно, ибо Александр I сам держался подобных взглядов.
Угнетенный расправой ставшего во главе морских сил России Мордвинова и его марионеток, обескураженный победой заведомо неправильных взглядов на значение флота, Ф. Ф. Ушаков решил удалиться от дел. На его глазах умалялся флот, которому он отдал беззаветно все свои силы, весь самобытный талант, огромные знания и всю свою славную жизнь.
19 декабря 1806 г. Ф. Ф. Ушаков подал прошение об отставке, объясняя причины её «душевною и телесною болезнью и опасением, по слабости в здоровьи, быть в тягость службе».
Несколько дней перед этим Фёдор Фёдорович внёс в фонд защиты отечества 2 000 рублей, пять пушек и бриллиантовый челинг, подаренные ему султаном.
17 января 1807 г. Ф. Ф. Ушаков был уволен в отставку.
Так печально закончилась безупречная боевая служба Ушакова своей родине. Фёдор Фёдорович прослужил во флоте 44 года, сделал на море 40 кампаний, участвовал в трёх войнах, а в двух последних командовал Черноморским флотом, не зная при этом поражений.