Однажды, въ концѣ лѣта 1472 года, къ ночи загорѣлись кельи на островкѣ и озарились багровымъ заревомъ шумящія, бушующія волны озера. Вѣтеръ рвался кругомъ; гудѣла буря. Иноки кидались въ лодки, тонули, переполняя ихъ, гибли. Съ берега темною ночью въ такую бурю подъѣхать было нельзя, и "погорѣ монастырь со всѣмъ узорочьемъ, и съ книгами, и съ кузнью, и съ кельи", говоритъ лѣтопись.
Но чтимое населеніемъ любимое мѣсто молитвы, обитель возникла изъ пепла въ новомъ преображенномъ видѣ. Островокъ сталъ застраиваться каменнымъ строеніемъ. Сынъ великаго князя Василія Темнаго Андрей Васильевичъ Меньшой, удѣльный князь Кубенскій, Вологодскій и Заозерскій, выстроилъ пятиглавый двухъэтажный храмъ въ 1487 году. Храмъ и повыаѣ существуетъ. Кирпичъ возили изъ Твери и Старицы. Лѣтопись говоритъ что то былъ первый каменный храмъ и первый по красотѣ во всей странѣ Вологодской.
Великій князь Василій Іоанновичъ со второю супругой своею Еленой Глинскою зимнимъ путемъ наѣзжалъ въ декабрѣ 1528 года на Каменный островъ. Онъ молился чтобы "далъ Богъ отродъ у него былъ", о чадородіи своей супруги. И 25го августа 1530 года у нихъ родился сынъ, знаменитый Иванъ Грозный.
Юношей 15 лѣтъ объѣзжалъ Грозный, въ маѣ и въ іюнѣ 1545 года, Кубену и Заозерье. Онъ прибылъ въ село Устье, на рѣкѣ Бубинѣ, всего въ семи верстахъ отъ Островка, и готовился посѣтитъ монастырь. Но каждый разъ, какъ онъ собирался, подымалась сильная непогодь, и онъ рѣшилъ не ѣздить на островъ. Не принялъ ли онъ это за какое-нибудь знаменіе, ибо послѣ, подолгу живя въ Вологдѣ, хотя посылалъ дары монастырю, но самъ туда уже не бывалъ. "Лѣта 7053, говорится въ царственной книгѣ, поѣхалъ государь.... бывъ на Бѣлѣ Озерѣ въ Кириловѣ, на Вологдѣ, Борисоглѣбскомъ на Устьѣ, воротился въ Москву іюля 7 день."
Ночью 24го августа 1657 года опять запылалъ пожаръ на Каменномъ островѣ. На островѣ, среди воды, безуспѣшны были людскія усилія. Пожаръ былъ повидимому страшный. "Монастырь выгорѣлъ, повѣствуетъ современное извѣстіе, образы погорѣли, церковные помосты обвалились, своды каменные на тѣхъ церквахъ порушились и колокола разлились, всякія службы безъ остатку сгорѣли, а тотъ де Спаской монастырь на острову и отъ того де Каменнаго монастыря бревенной лѣсъ верстахъ въ сорокѣхъ и больше"....
Такимъ образомъ мы имѣемъ современное свидѣтельство что уже и тогда (1657) бревевной лѣсъ кругомъ озера вырубленъ былъ верстъ на 40 въ окружности.
И опять (что показываетъ почитаніе и уваженіе какимъ пользовалась обитель) не прошло и 12 лѣтъ отъ этого пожара, какъ опись {Эта въ высшей отелени интересная опись приведена въ сочиненіи г. Суворова (приложенія) стр. 58.} произведенная по указу преосвященнаго Симои Вологодскаго застаетъ монастырь въ полномъ благоустройствѣ и великолѣпіи. Предалтарный иконостасъ, въ пять ярусовъ, въ Успенской церкви, горѣлъ золотомъ и серебромъ, цвѣтными камнями и жемчугомъ. {Библіотека и архивъ монастыря имѣли много книгъ и рукописей къ сожалѣнію на половину сгорѣвшихъ, и розданный благодѣющими монастыремъ хлѣбъ крестьянамъ очиталик тысячами четвертей за ними не возвращеннымъ.}
Въ 1774 году, въ томъ же мѣсяцѣ іюлѣ, когда былъ заклы чемъ Кучукъ-Кайнарджійскій миръ, многострадальный монастырь сгорѣлъ въ третій разъ. Каменный островокъ по своему уединенному положенію найденъ удобнымъ какъ мѣсто ссылки и заточенія разныхъ опальныхъ лицъ. {Сюда въ 1730 году сосланъ былъ неповинный, лишенный архіерейскаго сана, Ростовскій архіепископъ Георгій Дашковъ.} Одинъ изъ ссыльныхъ, привезенныхъ сюда изъ Кирилова, помѣшанный -- лицо неизвѣстное -- былъ какимъ-то образомъ виновникомъ бѣдствія Этотъ пожаръ былъ много слабѣе прежнихъ, ибо собственно сгорѣли деревянныя надворныя строенія и вообще все деревянное въ зданіяхъ. Въ это время умеръ преосвященный Іосифа Вологодскій и не пріѣхалъ на смѣну ему новый Ириней, какъ воспользовавшись междувластіемъ, Вологодская духовная консисторія, донося о пожарѣ, представила необходимость "упразднить" древнюю народную святыню. Тогда это не встрѣтило по видимому никакихъ затрудненій, послѣдовало очень скоро разрѣшеніе, и многолѣтній духовный стражъ Заозерья, лелѣемый, почитаемый и украшенный много лѣтъ сердечною любовью русскихъ князей и народа, былъ, безъ особыхъ околичностей "упраздненъ", и церковная утварь и братія переведены въ Святодуховъ. Мало того, даже древнее каменное строеніе велѣно было тѣмъ же указомъ свозить и употреблять на надобности святодуховской братіи. Но это послѣднее не приводилось въ исполненіе, и обгорѣлыя стѣны древней обители въ торжественномъ безмолвіи, какъ бы нѣмымъ укоромъ, 26 лѣтъ, въ запустѣніи, высились надъ волнами своего роднаго озера.
Но сердце народное не могло, подобно консисторіи, относиться легко къ такому "упраздненію". Съ 1799 года начинаются упорныя и постоянныя ходатайства о возстановленіи дреавей святыни, такъ почитаемой. Ходатайствовали предъ синодомъ, подавали прошеніе лично государю. Въ ходатайствѣ участвовало и дворянство, и купечество, и крестьянство. Прошеніе подано было и цесаревичу Константину Павловичу, который принялъ въ дѣлѣ живое участіе. При этомъ, замѣчательно" повѣреннымъ отъ всѣхъ сословій и ходатаемъ по этому дѣлу въ Петербургѣ былъ крѣпостной, вотчинный крестьянинъ полковницы Вѣры Кожиной, Василій Блохиновъ. Просители принимали на себя все -- и возобновленіе обители и будущее ея содержаніе. Такая просьба не могла быть не уважена, и по повелѣнію императора Павла, указомъ святѣйшаго синода предписано: "упраздненный Спасо-Каменный монастырь возстановится".
Скоро застучали топоры на оживившемся Каменномъ островкѣ, и засіяли яркіе кресты пятиглаваго храма. Усердіе окрестныхъ жителей возстановило даже въ лучшемъ видѣ свою любимую обитель. И забѣлѣлись опять высокія стѣны церквей и келій.